Format, który pamięta przeźroczystość to PNG lub GIF. Współcześnie jednak PNG...Cezary Czapski pisze:Logo ze strony głównej chyba nie ma tła - tego używałeś
Photoshop na etapie obróbki pamięta przeźroczystość (to co wytniesz w edycji będzie przeźroczyste). Zupełnie inną kwestią jest format wyjściowy i tu właśnie polecam PNG.